最近几年，研究人员担忧三氯生的普遍用于不会造成抗生素耐药性或对人类微生物菌群产生有利影响。2013年，美国食品药品管理局公布了一份规则，拒绝抗菌香皂和沐浴露的制造商在一年内获取一份证据，该证据必须证明所含三氯生的产品是安全性的，比普通香皂能更加有效地的防治疾病。

市场对系统称之为在美国早已相当大程度上从商业肥皂中去除了三氯生，但在美国一些医院洗手产品和最少见的牙膏如高露洁中依然不存在。三氯生可增加斑块负荷和牙龈炎。

在新的双盲、随机、交叉研究中，斯坦福大学研究人员随机提取13个身体健康个体持续用于家用和个人护理产品(牙膏、洗手液，洗洁精)四个月，这些产品中有的所含三氯生，有的不不含三氯生。四个月后，他们用于其它替代物。研究人员分析了血液样本的新陈代谢和内分泌标记，尿液样本的三氯生，粪便和口腔样本的微生物菌群包含。所含三氯生的产品对尿液中的三氯生含量有显著影响，而对口腔或肠道微生物或新陈代谢标记没明显影响。

“我们找到，有些微生物转变了一点，但是口腔菌群或肠道菌群没相当大转变。”Parsonnet博士说道。

“对于十分惧怕三氯生的人，这项研究应当让人安心。

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